“定远”级铁甲舰的防护设计采用的是与“不屈”、“萨克森”相同的铁甲堡式。铁甲堡长度达48.5米，自上层建筑到舷侧水线及水线以下，以305～355毫米的钢面铁甲将军舰除首尾部分外的船体紧密包裹，整个军舰中部要害部位如弹药库、动力部门等均处于铁甲堡防护中。需要指出的是，在“定远”级建造之时，世界上最新式的装甲为英国发明的康邦装甲，即钢铁复合装甲，又称钢面铁甲，其中“定远”舰采用了英国制造的钢面铁甲。但德国人不想全部使用英国人的钢面铁甲，想在这方面打开自己的局成，是以德国人通过反复试验，最终生产出了自己的钢面铁甲，并最先应用到了“镇远”舰上。“萨克森”级铁甲舰中2艘建造时间晚于“镇远”舰的军舰，即应时采用了钢面铁甲。“镇远”舰成为德国造船工业中第一型采用复合装甲的军舰，为德国舰船工业提供了技术积累。
在铁甲堡防护区域之外，“定远”级铁甲舰的首尾敷设有76毫米厚的装甲甲板以加强防护能力，2座305毫米露炮台的炮座采用305毫米的装甲，而305毫米大炮的半敞开式炮盾厚度则只有薄薄的4英寸。舰体内部结构方面，采用双层底和水密隔舱设计：“船底铁板以上相距一迈当（米）余，有双层底铁板，用龙骨脊板上下抵连，又用直肋纵横相连，截成隔堵五十八格，使临战时船底偶有触损，水入不能通灌。双层底上分上、中、下舱3层……上、中、下舱各以铁板横直成壁，为隔舱一百五十四间，为受弹时水灌之备”。
“定远”级铁甲舰的外部的甲板主要分为2层，均敷设柚木地板。位置在下的一层是主甲板，由于干舷较低容易上浪，平时主要在装煤作业和起锚作业时使用。在舰体中部的主甲板上，左右共分布了12个类似下水道盖的铁盖，这便是煤舱的填煤口；在填煤口附近，还有12个直径稍小的盖子，是用于给甲板下采光的采光窗，在军舰后部主甲板上也有16个同样功能的采光窗。在主甲板前部，舰首左右各有一块内侧高外侧低的锚床，上面摆放有2大2小共4个铁锚，由首楼甲板上的2根巨大的吊臂来吊放使用。主甲板后部，舰尾左右也各有一块略小的锚床，摆放2个标准的海军锚，由附近的2件吊锚杆吊放。此外在靠近船首的两舷各有一组吊艇架，悬挂2艘8桨舢板小艇。
“定远”级铁甲舰的主要作业甲板是位于首尾楼顶部的甲板，这里是水兵的主活动区域。(www.81ks.cc 八一中文网。)