崇祯的看法很简单，兵权只有高度的集中统一才有较强的战斗力，而只有皇权紧紧抓着兵权时，地方或朝廷才不会有任何变故。
从这个角度来看，五军都督府不能裁撤，反而需要加强。
诚然，现在的五军都督府早成了兵部的附属，的确需要加强，但加强也需要一个度，做起来又很麻烦。
如果过分加强，造成武将的拥兵自重，朝廷管辖不及，反而会出现更大的乱子。
明朝前期大都督府权力的削弱和兵部权力的加强是一种进步，对增强军队战斗力有利。
崇祯正在做的，是重新加强已经被削弱到极点的五军都督府，进一步打压文官集团。
统一于文官的兵部不会对皇权构成威胁，但加强太过的五军都督府军将们，则会对朝廷造成直接影响。
因此可以说，现在崇祯手上的大明，基本建立了既能增强军队战斗力，又不妨害集权的军事领导体制。
当然这种领导体制并不完善，兵部和朝廷对前线指挥干预过多就是其中之一。
崇祯皇帝取消太监监军，再裁掉了大部分无用的总督，正是避免这种干预的手段。
在全国军队之上，将忠于皇权的禁军和京军设置为一整套体制的金字塔顶点，也是保证军权在手的方式。