诸葛墨的这种办法还是很见效的，逐渐开始消耗掉守城一方的实力，并且在连番不分昼夜的侵扰下，使得守城的一方开始有些疲于应付。
最终，诸葛墨麾下的机关兽兵团找到了机会，在某天夜里突然发起强攻，机关兽直接功上京都城的城楼，险些就要攻入京都城中去。
好在斯科特率领的机械兵团及时发现，做出了最妥当的应对，在关键时刻封堵住城楼与城内的道路，将机关兽兵团给挡在城楼上，并且大批机械战士奋不顾身冲上前，大战那些机关兽。
那场战争异常的惨烈，大量机关兽被毁掉，同时一些机械战士也同样被毁，使得斯科特麾下机械兵团损耗增加。
也使得京都城内外战局变得扑朔迷离，不到最后一刻谁也不知道会是怎样的结局，战斗的双方都渴望获得胜利，但是各自的砝码都已经加上，显然局势仍旧是焦灼。
几番交锋和争渡之下，在诸葛墨机关兽兵团建功的时候，那些木下秀吉旧部再次发起进攻，趁着城内乱作一团，应付机关兽的时候，居然强行攻破京都的城门，城门破开城外大军顿时开始涌入到城内去。
原本的攻防战，瞬间就变成了京都城内的巷战，双方在城内的街道上展开大战，便是那些京都城内的民众，也都卷入到激战之中去。
可以说，转眼间整座京都城，都彻底陷入到战火之中，而且京都城内的一方渐渐开始落入下风，尤其是诸葛墨亮出另外一批机关兽，更是让胜利天平开始倒向攻入城的一方。
守城的一方几乎已经开始有些绝望，似乎觉得他们无法战胜对方，即便他们拥有机械兵团的帮助，但还是无法抵挡住对方即将攻克京都城的步伐。
千钧一发之际，三号和四号从天而降，而被视为是须佐之男的明棠也出现，给了原本绝望的人们带来了希望。
三号和四号率领另一批机械战士加入战局，明棠赐予京都城内武士们神力，使得局势再次发生惊天逆转。
木下秀吉麾下攻入城的旧臣中，有七人战死在了京都城内，诸葛墨手上攻入城的机关兽也几乎是全军覆没，若非诸葛墨还有那头老黄牛保护自己，恐怕他自己也可能会死在城内。
老黄牛在紧要关头，爆发出可怕的冲击力，硬是冲破了京都城内的重重包围，带着诸葛墨从京都城内冲了出去，算是救下诸葛墨的一条命。
险些丢掉性命的诸葛墨，在自己老黄牛的奔驰下，冲出京都城之后，一路狂奔居然硬是甩掉了紧追不舍的机械兵团。
即便是三号和四号也是感到十分无奈，完全没有料到那头老黄牛的速度会那样快，机械兵团内最擅长奔跑的机械战士，都没有能够追上那头木质的机关老牛。
不过虽然没有能够抓到诸葛墨，但是京都城的危机算是解除，诸葛墨尽管逃掉，但是他手上机关兽兵团全军覆没。
另外木下秀吉的那支大军，也是几乎完全被围困在城内，大多数都被歼灭，剩下的则选择了投降。
经过持续将近一个月时间，京都城的战争终于彻底的结束，满目疮痍的京都城迎来了久违的安宁，至于剩下的一些善后的事情，则已经不是鲁修斯麾下的机械兵团需要去处理的，那是坐镇京都的天皇陛下，以及德川家彦和太原雪斋等人要烦恼的。