在双方争吵不下时，库伦之战的消息传回了沈阳。虽然多尔衮没有抓到林丹汗，但是林丹汗消失在漠北的消息，已经让黄台吉等后金亲贵们意识到，一个彻底击溃蒙古的机会来临了。
在林丹汗西迁击败了右翼的土默特等部族之后，漠南蒙古除了林丹汗之外实际已经没有第二个有影响力的蒙古首领了。现在林丹汗的失踪，意味着察哈尔部及漠南蒙古诸部失去了一个名义的主人，这正是后金吞并漠南蒙古诸部的大好时机。
只要能够在林丹汗返回漠南之前，或是察哈尔部决定出新的继承人之前迫使漠南各部归顺于后金，那么蒙古草原的形势会出现翻天覆地的变化。而后金也打开了通往草原的通道。
于是黄台吉同莽古尔泰为首的女真亲贵们达成了妥协，决定出兵察罕浩特并伺机进攻河套地区的察哈尔部，做好彻底解决察哈尔部的准备。于此同时，黄台吉还派出了大批的使者去游说漠南草原东部及呼伦贝尔草原一带的蒙古部族，想要令这些部族成为后金的臣民。
在后金这边忙着做出兵准备时，草原也乱成了一片。外喀尔喀的札萨克图汗、土谢图汗、车臣汗带着右翼部族的蒙古那颜们抵达库伦后，始终没能找到林丹汗的下落，也没能收到林丹汗安然返回漠南的消息，这令漠北蒙古诸部也是有些惊慌失措。
最终札萨克图汗、土谢图汗、车臣汗三人商议后，决定以对待外国君主最为贵重的礼节，以一白驼、八白马为礼，送于多尔衮率领的后金军队，感谢他们解救了外喀尔喀右翼，并希望能够借此礼送对方离开漠北，好让他们慢慢搜索林丹汗的下落。
绰克图汗在得知了库伦之战的结果之后，便有些惶惶不可终日。他不愿意听从逃到他部落的贵英恰的建议，立刻起兵反扑库伦，以扭转不利局势。反而听从了多尔衮派出使者的建议，同札萨克图汗、土谢图汗、车臣汗等右翼部族言和，并向后金称臣。
贵英恰对此很是失望，于是便带着陆续逃来的千余部属返回了漠南。正在察罕浩特重修城池，并笼络附近部族的衮楚克台吉听到了这个消息之后，便立刻意识到了察哈尔内部及草原的局势都将出现巨大的变化。
他不甘心错过这个机会，因此留下了招揽来的部族驻守察罕浩特，自己则带着挑选出来的三千青壮赶回了归化城，试图争夺林丹汗死后留下来的巨大权力。
袁崇焕等明国边疆官吏收到了林丹汗在库伦战败并失踪的消息后，马将这一消息传回了京城，并开始加强对于大漠边境的巡逻，以准备接应林丹汗的逃归。
袁崇焕则对着丰大总督府的一干部属说道：“林丹汗此时失踪，我觉得不是已经死亡了是被人所虏去另有所图。这两种情况对于大明来说都相当不利，原本可以和我大明相互扶持的察哈尔部失去了林丹汗这个主心骨后，必然会陷入一轮汗位的继承人之战，那么草原的各部未必还会听命于没有大汗的察哈尔部了。
后金若是趁机冲进草原，恐怕草原的地利从此要两家共享了。要是林丹汗已经被人软禁，那么对我们的形势更严重了。假设林丹汗向后金还是漠北部族屈服，都有可能让察哈尔部成为我们大明的敌人。
由是看来，对于察哈尔部内部的权力更替，我们不可能不加以插手，我们绝不能容许一个反明人士登蒙古大汗的汗位…”
袁崇焕的主张得到了大多数人的支持，认为在这样的状况下，应当保卫察哈尔部进行和平的权力交接，而不能出现流血事件，避免为后金所乘。
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