紧接着，朝廷诏旨又下：致仕官员解缙、方孝孺等十三人被颁布了禁足令，也就是说没有皇上的谕旨，这十三个人永远不能出府门半步，也不允许有人探视。
锦衣卫指挥使李祺调任云南都司指挥使，齐泰接任锦衣卫指挥使的职务。同时京城之中，朝廷官员遇刺一事，又牵涉数十人入狱，皇上有好生之德，广施仁政。钦判这些人为苦役，发于东行舰队之中为水手，永世不得上岸。
一场这么大的风波，就被自己的父皇如此的压制下去了，朱棣由内心深处生出一阵阵的寒意，这次风波中，受损失最大的，果然是太子一系，解缙、方孝孺他们只是禁足，数十人的苦役。而且其中也有太子一系的干将。
而自己呢。原来一向不理会北平吏治的父皇。却没有征求过自己的任何意见，就将北平上下的官员换了一遍，这是为什么？
朱棣突然产生一种身心俱疲的感觉。父皇步步紧逼，他的自信心已渐程不支之势。自己刚想伸手南方。就被父皇给砍了下来，难道父皇真的不想传位于自己吗？
朱棣忽然觉得愤怒：自己在北平戍边十余载，虽说没有什么大的功劳，但是作为燕王守国门，又因为自己方法得当的缘故，吸引了大批的文人儒士前来效命，同时也带动了辽东的经济，教育等等。没有功劳也有苦劳吧。且自己平日又谨慎恭顺，哪有什么过错可言？为什么要设置这么多的障碍给自己呢？
就这样暗暗想着。心中先是愤怒，继而恐惧，到最后却又感到一丝悲哀。忽然，一个念头从他心中冒起，朱棣隻然而起。急匆匆的在房中转了几圈，却又颓然坐下。仍是拿不定主意。终于，他一把推开槅门，对侍立在远处的侍卫喝道：“去法云寺将智光师傅请来，快些！”
四月十五乃孝慈马皇后忌辰。这一日北平燕王府上下尽皆缟素，太子朱棣与正妃率领在北平的宗室来到位于寝殿右面的宗庙，面对太祖灵位行祭奠之礼。
朱棣行礼时眼泪滚滚而下。在他的带动下，宗庙内一片哀嚎之声，气氛十分哀戚。之所以如此悲痛，一方面固是为人子孙的应有的孝义，更重要的却是为自己前途惨淡而心伤不已。
就在同一天的南京城内，从宗庙出来，太子朱标命太子妃率众人回宫休息，自己则带了侍卫前往东殿议事。
当朱棣踏进殿门时，方孝孺、方中仁、方中宪父子三人与智光和尚已经奉命在殿内等候多时，同在殿内的还有东宫詹事府的张宗浚。
刚刚坐稳，朱标就说道：“孤准备去拜见父皇，不知各位有什么意见？”
当然，朱标所谓的拜见父皇不过是一个借口而已，真正的目的，还是想见见他那个深不可测的父皇朱元璋。
“殿下怕了？”别人不敢出声，但是方孝孺却敢反问道。
“怕和不怕有什么区别？”智光和尚也应声而出，继续说道：“贫僧认为，殿下何苦如此，皇上现在的意思已经很明白了，太子没有应召还是不好冒然拜见皇上还好，去了，往往是越做越错，不去，或许有一线机会！！！”
“住口，太子决议乃是政事，哪能允许你这个和尚插口……。”方孝孺年事已高，但是脾气却是不减，厉声喝问道。他的想法虽然和智光差不多，但是就是不想由和尚插手东宫事务，而且方孝孺隐隐感觉到，自从太子见过这个老和尚之后，心性变的有些不稳，做事也没有了分寸，这是一个不好的兆头。
更何况方孝孺是过来人，明白这些和尚平时满嘴的慈悲为怀，张口就是无欲无求，闭口就是阿弥陀佛，但是吃起人来，从来是不吐骨头的。皇上现在抑佛崇道，太子这样亲近僧人，无疑在别人的眼里是和皇上唱对台戏，而这一点正是皇上会如此对待东宫的原因之一，方孝孺是这样认为的。
“老师……。”朱标看见方孝孺如此对待自己的师傅，虽然在积威之下，不敢对方孝孺斥责，但是已经露出不愉之色，但是智光却好像没有事的人一般。
双手合什，朝方孝孺一躬，神色自若的道：“贫僧知错，但是方大人难道不认同老衲之言吗？”
正所谓伸手不打笑脸人，儒家的礼教思想让方孝孺闷哼一声，但是却不好再理会智光，只是将头转向一边，任由智光说下去：“老衲以为，皇上如此做，却恰恰是在维护太子。最近京师朝堂之上并不安稳，若真的追究下去，恐怕马上所有的矛盾都会暴露出来，到时间皇上想不杀人都不行了。”
“殿下想想，此时牵涉太子以及两个皇子，三方大臣的争执，一旦挑明，那就是不死不休的局面，刚刚创立的繁华大明就要受到朝堂之上的影响，皇上要不就效法洪武初期的雷霆之怒。妄动杀机。引起朝堂之上的腥风血雨。那是，无论是三方的那一方，都要承受牺牲的后果，皇上为了均衡势力。绝对不可能偏袒任何一方，而且一杀就没有了尽头，殿下试想，结果会是怎么样？”
朱标点头，方孝孺也将头转了回来，这一点他早就看透了，但是没有想到这个和尚也是看的如此透彻，也不能不让他承认这个和尚的确有过人之处。
智光继续说道：“不过那样的话，有违于皇上的仁政思想。所以皇上选择了不杀，也只有息事宁人，但是方俊涉嫌朝廷命官的遇刺，都和他脱不了关系，唯有拿他开刀。才能不牵连太子的声誉。”
智光的一番分析，让