此后蒙古发兵两次攻打，尤其是第三次元朝发江淮、江西、湖广三行省的元朝、汉南军，以及云南兵、海外四州黎兵，分道入侵越南。张文虎等跟随大军从海路运粮七十万石。设置征交趾行尚书省，奥鲁赤为平章事，乌马儿、樊楫总领政事，受镇南王节制。这一次无论是兵力，还是粮草都准备极为充足，从第二日开始攻占，可结果安南禁军守卫泠泾关，兴德侯瓘将兵逆战，用毒箭射击元朝军，元朝军死伤甚重，退到武高关。二十八日，判首上位仁德侯璇在多某湾与元朝军对战，元朝军再次失败，安南军俘获敌军四十人及舟船武器等。
战事以元朝三次侵越失败，此后元世祖仍不希望就此终止对越战争。第二年，元世祖仍打算向越南派兵，但因时间仓卒而未能继续。越南陈朝取得胜利后，随即派出使者入元，请求按前例向元朝朝贡。元世祖亦无心恋战，应允和议，双方便恢复过往的宗藩关系。虽然元世祖在去世前有意以越南国王不肯来朝为口实，再度兴兵侵越，但刚好因他的去世而计划终止，此后元朝多有进攻，却是得不偿失……？“
“看来，这安南果然是块不祥之地啊，朕虽心有不甘，但眼下的局面让朕不得不放弃？“朱瞻基在心头默默盘算了一番，当年成祖应安南陈氏之邀，不得不出兵安南，此后一时心动，便占领了安南，依着张辅强有力的军事才能，四次出兵，灭了胡氏，打击了陈氏，才一举将安南纳入了大明版图。
当时成祖为取得安南的百姓支持，声称为了回应当地官吏耆老“原复古郡县”的请求，便将之改名“交趾”，依照明朝中国的行政区划模式，设置都指挥使司、承宣布政使司、提刑按察使司等“三司”。接着，明廷在交址设十五府、三十六州、一百八十多个县，以及五个直隶布政司的州，分辖二十九县，在要地则设十一卫、三所，一市舶司。
为了更好的治理安南，明成祖很是下了一番功夫，先是交址人口，采取与中国相同的黄册制度来办理。官府把交址人丁的姓名、年龄和籍贯，记载到簿册，并按这些资料，制成证件，由人丁持有，以备官府查核。若发现某人的证件与簿册所载不符，便须抓去当兵。
明人官府的薄册，会登记交址境内每一里（在乡村，则设立里甲制，以一百一十户为一里，十户为一甲，里有里长，甲有甲首）、一坊（城市）及一厢（城郊）的所有丁数及田数。孤寡残疾者则另用称为“畸零”的簿册来登记。这些簿册又会在卷首绘画地图。簿册编制完毕后，即抄成一式四份，一份黄色封面的交到中央户部，其余三份封面为青色，交给交址承宣布政使司及各府、县保存。每十年更新田丁的数目，这样保证了安南的人口数目，便于收取赋税。
第二点是在赋税经济上，因为安南偏于南方，又是刚刚臣服，所以在统治之初，朝廷对交趾采行多项税务及赋役制度。负责征收的官员，在府州县有税课司、河泊所副使等，另外有本场局使副等名目，永乐十二年，明廷规定交址每亩田征粟五升，植桑沙每亩征丝一两，每一斤丝征绢一匹。明政府又设盐税，交趾人民每月煮盐若干，送交提举司收藏，待承宣布政使司检验后，才可发卖。若私煮或私卖，则会被判罪。可以说这方面还是手下留情了，当然了，也不是一点好处也没有，在开取交趾资源，运回中国。凡是金银矿产，都设官督民开采。在山林地区，令人民寻找象牙、犀角。在海滨地区，令人民到下海采集珍珠。
另外，土产如胡椒、香料，以及珍禽异兽如鹿、象、龟、雀、猿、蛇等，都大肆搜刮，以带回中国，这些东西都是稀有的东西，对于充实皇宫，为郑和下西洋带来了不好好处，但比起大明的投入又算不得什么。
第三点从文教上，从永乐五年，朝廷就在交趾开设学校，访求有在儒学、医术、僧道方面有才能的，都委以官职，并使之教授有关才艺。而在交趾人的学习课程方面，明廷把中国儒家典籍中的《四书五经》、《性理大全》等书颁发给各州县做读本，并派僧道传布佛教、道教。
对交趾的读书人，明廷在占领之初便致力招揽。如在永乐年农历六月癸卯，明成祖向交址总兵官张辅等下令，将该地“怀才抱德、山林隐逸、明经能文、博学有才、贤良方正、孝弟力田、聪明正直、廉能干济、练达吏事、精通书算、明习兵法、武艺智谋、容貌魁伟、语言便利、膂力勇敢、yin阳术数、医药方脉之人，悉心访求，以礼送赴京擢用。”
后来更制定了岁贡生进入国子监的措施：起初规定府学每年两名入选，州学每两年三名入选，县学每年一名入选。后来改为：府学每年一名入选，州学每三年两名入选，县学每两年一名入选。由承宣布政使司、提刑按察使司及府州县地方官员负责，安排生员在入选后第二年的农历正月一日进京朝觐。至于入选为岁贡生进入国子监的条件，则是“不拘入学年月浅深，择有学行者”。这样做，从根本上，就是想让安南人被大明先进的文化所同化，为此成祖花费了不少心思，如今看来效果并不大。
除以上三个方面外，为了便于管理安南，明廷听从总兵官张辅的建议，从广西钦州地区至东关城（今越南河内）一带，建立驿站系统。于是，明政府于东关城至慈山府嘉林县（今越南北宁省嘉平县