朝廷随后任命幽州牧刘惠出任兖州牧，任命宁州牧杜幾出任豫州牧，任命刘放接替了幽州牧，任命国渊接替了宁州牧。
刘惠是最早追随刘和的属下之一，又在幽州这块刘和的根基之地从政多年，正好可以把幽州的成功经验带到已经开始部分改革的兖州来。推动兖州走上快速发展的道路。杜幾是文武全才，有着长期在边塞统领军政的经验，刘和将他放在豫州这块与荆州和江东交界的地方，自然是委以重任，有着防备和牵制刘表与孙坚的用意在内。
又过了一年，兖州和豫州已经彻底归于中央朝廷的管理之下后，朝廷的政体改革正式启动。
先是朝廷恢复了丞相制，但不设左右丞相，只设一位总管全国政事的丞相，在丞相之下又设了三位副职。分别是尚书令、中书令和内史令，负责在皇帝与丞相之间沟通，同时协助和监督丞相完成肩负的职责。刘虞作为大汉复兴的首功之人，自然被委任为丞相，而卢植则被任命为尚书令，统领尚书台的事务。刘表被朝廷任命为中书令，可以暂时不来洛阳赴任，他在洛阳的职事暂由中书丞（中书令副手）钟繇来担任。蔡邕被朝廷任命为内史令。
在丞相和三位副丞相之下，朝廷又设立了吏、礼、宣、户、刑、农、工、商、财、矿等十数个部。每部有长官一名，副职两名。
从朝廷的顶层的这番改变来看，既有后世三省六部的影子，但又很多的不同。这自然又是出自刘和的考虑和设计。比如，后世的三省六部之上并无大权独揽的丞相，而六部之中有个兵部，却没有出现在刘和搞出来的这十几个部之中。在刘和的设计中。大汉未来的政体是要朝着君主立宪的方向发展，因此必须要提高丞相的职务，使得丞相能够有实力来限制皇帝的权力。避免一两个昏庸无能的皇帝送葬了一个帝国。
丞相的职责，可以用一句话来概括：协助皇帝管理一切军国大事，即所谓的“掌丞天子，助理万机。”丞相负责管理军政大计或其他要务，并辅佐皇上处理国家大事。逢有机要事情皇帝召集公卿、二千石、博士共同在御前商议，避免专断。一般政务，则由丞相决定即可施行。皇帝有事，常向丞相咨询，丞相有时可封驳诏书，表示对皇帝命令持保留态度。丞相具体职权是：任用官吏，或是向皇帝荐举人才；对于地方官的有考课和黜陟、诛赏的权力；主管律、令及有关刑狱事务；地方上若有暴动等事，丞相派属官前往镇压；在军事或边防方面也承担一定的责任；全国的计籍和各种图籍等档案都归丞相府保存。西汉时御史大夫辅佐丞相，职掌大致相同，所以不少事务常由丞相、御史共同出面处置
作为后来人，刘和纵览史书，从来没有发现丞相造反夺取了皇帝君权的事例，反倒是那些废除了丞相把君权高度集中在手里的皇帝，最终都把帝国带进了覆灭之地。因为这里面有一个很简单的道理，丞相虽然总揽全国的军政大事，但他是由皇帝任命的，而且在刘和的设计中，军队这一块是独立出来与内政官员并列的，所以丞相一个人的权力再大，也无法发动一场颠覆皇权的内乱。
皇帝作为帝国的象征和最高决策者，他不需要也不应该事事插手，他要做的是监督丞相和内阁官员，避免权力被集中在少数人的手中。想要让帝国长久维持下去，皇帝不仅不能**集权，反而应该将无上的权力合理的分配下去，这样在遇到重大变故的时候，好歹还有一群人维护帝国的完整和统一。
朝廷在任命内政官员的同时，也对军队的体制进行了变革。刘和头上顶着的兵马大元帅依然保留，在朝中与丞相的地位相同，在兵马大元帅府中设置枢密院，枢密院内又设东西两府，其中东府长官负责作战和平叛，西府长官负责训练和装备后勤。
一位丞相，三位副相，再加上一位大元帅和两位副职，便组成了大汉的最高权力机构，也就是内阁。
在皇帝之下，除了丞相和大元帅负责政事和军事，还单独设立了议政院、立法院、监察院、审判院四个由皇帝和内阁双重领导的机构。
之所以叫做双重领导，既是为了防止皇帝利用这四院来架空甚至是迫害内阁大臣，也是为了防止内阁大臣蒙蔽皇帝。
当议政院就一个重大的政治议题进行讨论分析时，作为皇帝和内阁大臣可以列席旁听，也可以在会上陈述自己的想法观点，但不得干扰议政院的投票公决。
当立法院广泛征集全国各地的民意制订出一部律法之后，先提交议政院进行最后的审核讨论，一旦议政院投票通过，则皇帝和内阁大臣也要严格遵守，无权废除和中止。
监察院负责监督纠察上至皇帝，下到百官，一旦掌握了确凿的证据，则可以提交审判院，由审判院根据大汉的律法对相关人员进行审判。皇帝和内阁大臣对监察院的执行公务有知情权，但不得插手干涉，而审判院做出最终的审判之后，皇帝在一年之中有三次特赦权，丞相和大元帅各有一次特赦权，其他内阁大臣则有一次复审权。特赦权只能免除死罪，但不能免除其他刑罚。