随后，朱由菘又假惺惺地面谕群臣道：“有一稚子言是先帝东宫，若是真先帝之子即朕之子，当抚养优恤，不令失所。”
接着就下令侯、伯、九卿、翰林、科、道等官同往审视真伪。
有了前车之鉴，前去辨认的官员众口一词，说这个太子是假冒的。
此时金陵的文武百官听闻此事，纷纷赶赴兴善寺，“踊跃趋谒”，朱由崧只得将假太子交付锦衣卫冯可宗处看管。
这件事直接牵涉到朱由菘皇位的合法性，对朱由崧继统不满的人乘机兴风作浪，散布流言蜚语，朝堂上掀起了一片喧哗。
朱由菘越说太子是假的，越疑其真的大臣就越多，这件事还引起了江防督抚袁继咸、广昌伯刘良佐等大臣上疏抗争的后果。
而“童妃案”更是把朱由菘的金陵小朝廷推向了深渊。