小智得到金黄徽章后，和在神奇宝贝中心休息了一晚，便和瑟蕾娜踏上了前往紫苑镇的路途。此时，一行人走到了一处散着雾气的树林。
“卡拉，卡拉。”一个啜泣的声音突然传来。
“小。。小智！这。。。这又是什么声音啊！”瑟蕾娜看着周围空荡荡的，只有这一个声音，吓得躲到了小智的身后。
“这个叫声听起来好像是，可拉可拉！”小智思索了一阵，说道。
“可拉可拉？”瑟蕾娜说着拿起了图鉴，看起了资料。
“可拉可拉。孤独神奇宝贝，属性地上，一直戴着已经去世的母亲的头盖骨，在满月之夜现已经无法再见的母亲的模样而大哭，戴着的头骨上的污点是泪水的痕迹。”
“走，我们过去看看。”小智道。
“好。”
不远处，灌木丛中。。。。
“卡拉，卡拉。”一只可拉可拉正在小声地啜泣，不过此时这小声嗯啜泣却在这个雾气的树林里显得有些诡异。
（可拉可拉，你怎么了？）
“卡拉！卡拉！（谁！谁在那！快出来！）”可拉可拉看向四周，也没现什么人。
“不用看了，我在这里。”小智说着从可拉可拉面前的树上跳了下来。
“卡拉！卡拉？（刚刚，就是你在和我说话？）”
（没错就是我。可拉可拉，你是有什么伤心事吗？怎么一个人在这里哭泣。）
“卡拉卡拉。卡拉。（我妈妈在昨天被一群人类杀害了。呜呜呜！）”可拉可拉毕竟是孩子，一下子就信了小智，开始哭诉起来。
（你妈妈的遗体在哪里？可以带我们过去看看吗？）
“卡拉卡拉！卡拉！（她被一个老人埋在了不远处一个镇子的一座塔里。我可以带你们过去。）”
（麻烦你了）
“小智！怎么样了？”就在这时，瑟蕾娜也过来了。
就在刚刚，小智用波导现了可拉可拉，就让皮卡丘保护瑟蕾娜，自己一个人先过来了。
“瑟蕾娜，这是一只失去母亲的可拉可拉，它母亲被火箭队杀害了，现在正埋在紫苑镇的神奇宝贝塔里，我怀疑，那边有火箭队。”小智说出了自己的猜想。
“什么！那还等什么！快点过去吧！”
“瑟蕾娜，你用你的宝贝球装一下可拉可拉，我们这就走。”
“好的！可拉可拉，你别伤心，人死不能复生，你要节哀。你放心，小智他一定会给你一个交代的。”瑟蕾娜应了一声，摸了摸可拉可拉的头，刚开始可拉可拉还有点害怕，可是看到瑟蕾娜的笑容后就释怀了。
紫苑镇，神奇宝贝塔。。。。。。
“富士博士，你应该知道我们火箭队的手段吧！乖乖地跟我们走一趟吧！”一个紫色头，身形和眼神都有些猥琐地男子正站在一个秃顶，白眉毛的老人面前，气焰嚣张地说道。这个男子就是兰姆达，而这个被火箭队包围抓住的老人就是富士老人，梦研究工程的研究员之一。
“火箭队！你们真是够了！告诉坂木，我是不会跟着你们继续研究的！”富士老人怒气几乎爆满，怒视着兰姆达。
“坂木老大说了，只要你交出目前梦的资料，你去不去也无所谓。快点交出来吧！如果你不交出来，那么，之前的那只嘎啦嘎啦就是下场，我们会一只只地杀死这附近的神奇宝贝。嘿嘿嘿。”兰姆达看着富士老人，不断地威胁道。
“你们！你们真是太可恶了！简直就不是人！”富士老人听到兰姆达的威胁，怒骂道。
“再给你三秒钟，三秒钟过后，你要是不交！我就先杀了你收留屋里的神奇宝贝。”兰姆达招了招手，立刻就有三个火箭队成员走了出去。
“三！”“二！”“一！”兰姆达数完了数，就要开口。
“等等！我交！不过资料在收留屋里，跟我过去拿吧！”富士老人无奈地摇了摇头。
“这才像话嘛！那么！走吧！”兰姆达说着让手下在顶层打开了一个洞，一个个火箭队成员用飞行器飞了出去。
塔下。。。。。
“这里就是神奇宝贝塔？好壮观啊！”瑟蕾娜看着这座十分高的塔，感叹道。
“嘘，瑟蕾娜，等下我们进去要保持严肃，毕竟这里有着神奇宝贝的魂魄。”小智说道。
“嗯，我会注意的。”
“走吧。”
就在火箭队离开的时候，小智和瑟蕾娜也刚刚到达了神奇宝贝塔下方。
小智和瑟蕾娜一路前行，一口气到达了第六层。
“骼拉骼拉！”小智正想着往顶层走去，可是空气中突然出现了一团影子。阻拦住了他们的脚步。
“是嘎啦嘎啦吗？”小智朝着黑影问道。
“骼拉骼拉！”
“瑟蕾娜！把可拉可拉放出来。”小智对着瑟蕾娜说道。
“啊？哦！好！”瑟蕾娜说着放出了可拉可拉。
“卡拉卡拉！卡拉卡拉！”可拉可拉一见到黑影，立刻跑了过去，哭泣起来。
“骼拉骼拉！”那团黑影见到可拉可拉，逐渐凝成了嘎啦嘎啦。
（嘎啦嘎啦！说说吧！你是怎么死的！）小智看见差不多了，用波导传音道。
“骼拉骼拉！骼拉骼拉！骼拉骼拉！骼拉骼拉！骼拉骼拉！骼拉骼拉！（人类！谢谢你们让我见到了我的孩子。我原本是被一群自称为火箭队的人类抓住了，他们说要做什么实验，抓了好多神奇宝贝，最后我逃了出来，结跑到了一位老人的屋