后来，元末天下大乱时期，终于惹起红巾百万起义，天下混乱，杀声一片。元军固然凶残至极，可是义军也不是好东西，往往便是元军刚刚屠戮焚烧，义军的乌合之众又蜂拥而至，恣意抢掠，那时百姓想做牛马而不可得。
那海岛上的大宋遗民自宋亡之后，无时无刻不在图谋恢复汉室。元末大乱方兴，岛上弟子便在东南起兵，攻破州县，割据一隅，有名的便有张士诚与方国珍。可是历经数代，这些遗民后裔，早已忘记先人初衷，一味贪图权势，自以为是，不但不想着匡定社稷，解民于倒悬，反而各逞私欲，互相攻打，以至于被元军各个击破。最后，元朝大丞相脱脱亲率百万大军，将张士诚围困于高邮城，准备一战而定东南，彻底肃清南方义军。
当此生死绝境，东海岛屿上的智者高士被迫尽弃前嫌，连成一气。所有的东岛弟子，无论亲疏贵贱，纷纷赴援高邮。那一战，可说是惊天动地、日月无光。元军人多势众，高邮外城几被荡平，内城也是岌岌可危。谁知东岛弟子不仅视死如归，抑且制造了许多可怕武器，屡屡重创元军。双方拉锯苦战，足有月余，元朝大军终于溃败，脱脱也被免职。从那之后，元廷再也无力聚集重兵，被迫放弃东南，退守北方。
倘若此时，东岛弟子仍能齐心协力，大可乘胜北伐。谁知道，强敌方退，岛内又因功赏不一，生出龃龉。转眼间，南方再次陷于混战，百姓重又落入水深火热之中。也就在这时，一个年轻人驾乘孤舟，自海外悄然归来，登上了江南的土地……