主角：漩涡鸣人 宇智波佐助 春野樱 旗木卡卡西 等
忍者始祖 六道仙人：人称忍者始祖，十尾 人柱力，轮回眼拥有者；
忍者组织 木叶十二忍：木叶村的十二位新一代杰出忍者的统称，有漩涡鸣人、春野樱、奈良鹿丸、秋道丁次、山中井野、犬冢牙、油女志乃、日向雏田、日向宁次、李洛克、天天，及已经叛离的宇智波佐助；
晓：一个由10名s级逃亡忍者组成的秘密组织。成员：零无-佩恩、白虎-小南、朱雀-宇智波鼬、南斗-干柿鬼鲛、青龙-迪达拉、玉女-赤砂之蝎、北斗-角都、三台-飞段、玄武-绝、空陈-大蛇丸。
根：团藏（死于佐助）、佐井、信、山中风（成为秽土转生祭品而死）、油女取根（被带土杀死）、寺井等；
三忍：自来也、大蛇丸，纲手
鹰小队：宇智波佐助、鬼灯水月、天秤重吾、香磷（脱离）；
猪鹿蝶：山中亥一、秋道丁座、奈良鹿久；山中井野、奈良鹿丸、秋道丁次
忍刀七人众：水之国雾隐村的精英忍者，前任者分别是桃地再不斩、林檎雨由利、通草野饵人、栗霰串丸、无梨甚八、西瓜山河豚鬼、鬼灯满月；继承者包括干柿鬼鲛、黑锄雷牙、长十郎等人。（除长十郎外已全部死亡）
音忍五人众：君麻吕（与我爱罗和李洛克对战时因病而亡）、鬼童丸（死于宁次）、左近右近（死于牙、勘九郎）、多由也（死于鹿丸、手鞠）、次郎坊（死于秋道丁次）
忍者家族 宇智波一族：原有宇智波带土、宇智波佐助、宇智波鼬、宇智波斑、宇智波泉奈、宇智波富岳、宇智波美琴、宇智波止水、宇智波镜，现仅剩宇智波佐助、宇智波斑。
日向一族：日向宁次、日向雏田、日向日差、日向花火、日向日足。
油女一族：油女志乃、油女志微（志乃之父）、油女志黑（取根之父）、油女取根（根的成员）、油女牟田（红豆小组的成员）。
山中一族：山中井野、山中亥一（井野之父）、山中风、山中三田
奈良一族：奈良鹿丸、奈良鹿久、奈良吉乃，奈良盐水
秋道一族：秋道丁次、秋道丁座、秋道取风。
旗木一族：旗木朔茂、旗木卡卡西。
森之千手一族：千手柱间，千手扉间、千手纲手、千手绳树（除纲手外全部阵亡）。
漩涡一族：漩涡鸣人、漩涡玖辛奈、波风水门、漩涡水户。
猿飞一族：猿飞日斩、猿飞阿斯玛、猿飞木叶丸。
其他 妙木山蛤蟆忍村：大蛤蟆仙人、深作仙人、志摩仙人、蛤蟆文太、蛤蟆健、蛤蟆广、蛤蟆吉、蛤蟆龙、蛤蟆忠、蛤蟆力、卷轴蛤蟆、妙木山岩宿大蛤蟆、铁臂蛤蟆、蛤蟆寅