“博士，我来拿神奇宝贝了”小智一进去，就喊道。
“小智啊，这么刻苦，现在还在训练神奇宝贝啊”大木博士出来后对着小智说道。
“不是啦，我是打算去橘子群岛挑战胜利者杯，所以带几只神奇宝贝一起去”小智说出了自己的打算。
“橘子群岛？那是什么”这时小霞和小刚出现了，于是好奇的问道（原来昨天小刚和小霞就来到研究所了，圣代由于学业回到了学校）。
“那是在关东地区以南的群岛，在大海上”大木博士听到小霞的问题后解释说。
“啊，夏之岛，穿泳装的小姐，真好，我也要去”小刚听到了大海后，立刻联想到泳装小姐，于是也要去。
“是大海啊，是水系神奇宝贝的乐园，我也要去”小霞听到大海后，也激动的说。
“对了，你们要去橘子群岛，刚好，我这里有一件事要拜托你”大木博士突然想起了什么事似的说道。
“没问题”小智知道是要去拿球。
“我希望你们为我去橘子群岛的岱柑岛一趟，我希望你们帮我去拿回岱柑岛的神奇宝贝学者内木博士所得到的未知宝贝球”博士解释说。
“博士，请她传送给你不就行了”小霞听到大木博士的话后提议说。
“问题就是没办法传送”大木博士听到小霞的建议后解释说。
“我们知道了，不过要等我挑战完橘子群岛的胜利者杯之后才能带回来”小智听完后立刻说道。
“反正研究也急不来，你就慢慢挑战吧”大木博士听了小智的话后，立刻同意说“我期待你的胜利对了，这次你要带那几只神奇宝贝呢”大木博士这时想到小智来的意图，然后问道。
“皮卡丘是肯定要带的，剩下的就暴鲤龙，比比鸟和冰六尾，其它的就呆在研究所休息和训练”
“知道了，我去把它们找来”说完大木博士向后院走去。
就在这时
“大木博士，我是新人训练家阿朵，过来领取新人精灵的”一个羞涩的女生推开门，低着头抠着手指，不好意思看着大木博士，在她的眼里，博士一般都是很严肃的老头子。
“原来是阿朵啊，三只小精灵都已经检查好了，非常健康。你打算选哪一只呢”大木博士弯下腰微笑的看着眼前的女生，可是阿朵还是不敢抬头看大木博士。
“阿朵放心吧，大木博士很善良的，不吓人的”小智认识眼前的这个女生，仅仅比自己小一岁的邻居家小女孩，早就熟识她，所以知道她在想什么。
听到小智的声音，阿朵才敢抬头看着大木博士“小智哥哥说的没错，大木爷爷果然不吓人”
“好了，阿朵，选择小精灵吧”大木博士放出三只小精灵的宝贝球，阿朵则是毫不犹豫的拿走了杰尼龟的宝贝球“大木爷爷，不用考虑了，我从小就喜欢水系小精灵，所以我就拿走杰尼龟好了”
“真是一个可爱的孩子，好了，那么就送给你六个神奇宝贝球和神奇宝贝图鉴，希望你多多训练你收服到的小精灵”大木博士则是拿出早就准备好了其他的物品。“那么你打算下一步去哪里旅行”
“我打算和小智哥哥一起走，开阔一下视野再决定以后的旅行”阿朵直接决定了自己的旅行。
“那么阿朵，你暂时就跟我们一起走吧”小智让阿朵跟着自己。
为了到达目的地，小智他们需要经过一个森林，现在他们就已经在森林里面了。
“这个森林你们不觉得怪怪的吗”小霞终于忍不住的问道。
“没有鸟叫，也没有虫鸣”小刚这时也发现了问题的说道。
“我有一种熟悉又不详的预感”小智说到。
“是烈雀群和大嘴雀”小霞看着从天空冲下来的几百只烈雀和一只大嘴雀说道。
大嘴雀一看到小智，便怒火中烧，朝小智他们攻击过来。
“好多啊，它们为什么要攻击我们啊”小霞一边向前跑，一边对着旁边的小智和小刚问道。
“不知道”小刚也一边跑着一边回答说。
“可能是来报仇的吧”这时小智心虚说到。
因为有小霞他们在，小智不好出手，怕自己难以护住他们。这时小智他们跑到了一棵大树下，结果…
“小鬼头，你们怎么来了”树上传来了武藏的声音。
“这应该是我们问的吧”小刚立刻说道。
“我们三个卷入了烈雀和bō_bō争夺地盘的战斗之中了”武藏指着一边的树上的bō_bō和比比鸟淡定的说道。
“因为会遭到烈雀和bō_bō的攻击，我们才特别不逃离这里的”这时小次郎也说道。
“小鬼头，这时候你一定要救我们，我们不想一辈子呆在这树上”喵喵眼泪汪汪的看着小智。
“原来如此啊，怪不得这些bō_bō和比比鸟都这么害怕”对神奇宝贝有敏锐观察的小刚看了看树上的bō_bō和比比鸟后说道。
“既然如此，那就来打败他们吧！烈雀群能这样，主要是因为大嘴雀的关系，只要打败并收服大嘴雀，烈雀群和bō_bō群就能保持一个平衡了”小智说完，派出了比比鸟。
“那么，我们也来帮忙吧！宝石海星，决定是你了”小霞听到小智的话后，也想尽一份力。
“好，大岩蛇你也去吧”小刚也派出了自己的神奇宝贝。
“比比鸟燕返”小智率先出去，大嘴雀一个措手不及。
“宝石海星使用十万伏特攻击烈雀群”小霞接着出来