并且，朝廷还规定了，州府郡县衙门吏员的选用权，将统一归府一级衙门管辖。逐步由贡生和将来的退役校尉和军卒替换现在吏员混乱的现状。
这是有利于集权统治的做法，同时也给予了地方州府主官一定的权限。
敢推行这样体制的基础，是国朝监察衙门的独立性，以及对君王直接负责的体制基础。
这样体制，很可能造成地方官有唯上的倾向。但是，监察衙门、吏部考功和朝廷担负本官俸禄，在一定程度上能避免地方州府主官乱政。
并且，官制改革还明确了，所有有品级的官员任命，必须经过吏部、内阁以及君王。即便是吏员任命，也必须经过吏部备案，同时将吏员在任时称职与否作为州府主官的考评内容之一。