至于御史台则由原孔有德麾下刘玄初出任御史大夫一职，其下三院各官员则同样由各郡县官员抽调。
军制方面则采用募兵制，主要由中央军、水师南北营、各督军和地方郡兵四部分组成。
中央军由东南西北中五军、左右卫军组成。
其中，东西南北中五军仍旧保持原有的编制，东西南北每军5万人，中军6万人，李定国为征东将军、李牧为征南将军、秦良玉为征西将军、斛律光为征北将军、王彦章为中领军，均为正二品官职。
左右卫军则再次调整，均扩充至每军2万5千人，武松为左卫军统领，兀突骨为右卫军统领，正二品官职。
其下，赵云、王彦童、龙威、龙猛、雄阔海、本多忠胜、向条、向充、向宠、施但、白云轩、冯国勇、冯胜、贺拔允、贺拔岳、刘世杰、公孙胜、刘唐、呼厨泉、彻里吉、褚云轩等一众将领则充任各军。
水师南北营分别由俞大猷、九鬼嘉隆两人出任统领之职，正二品官职，每营维持5万人的编制。
夔州孟珙投效司马宇之后，为协助孟珙抵挡南面湘军的入侵，水师北营移师夔州，水师南营则在九鬼嘉隆的率领下移师原水师北营驻地中坝岛，负责保护长江上游航道。
除了中央五军、水师南北营和地方郡兵之外，在此基础上还增加了督军府这一编制，主要设置在各军事要地。
目前，整个华国境内已有五个已经设立的督军府，分别是设立在永州北部、昌州南部、夔州、恭州和津州南部，共计辖兵24万。
在永州北部设置三郡督军府，由慕容翰出任督军一职，从三品官职，总辖云龙、陈食、金沙三郡军事，督军府辖兵3万，主要用以防备永州东北两面。
在昌州南部设置上丰、石道两郡督军府，崔州平调入中央出任工部尚书之后由原北军副帅贺拔胜接任，督军府辖兵3万，主要负责抵挡西北两面的威胁。
在夔州设置夔州总督府，由孟珙出任总督之职，正二品官职，负责总辖夔州军政要事，总督府辖兵8万。
在恭州设置恭州总督府，名义上由越嶲王任贵出任，实权却掌握在总督府左右司马郭淮、忙牙长二人手中，总督府辖兵6万，总镇恭州各部。
在津州南部设置五郡督军府，由驻津州西军征西将军秦良玉兼任，从二品官职，总辖津州南部白露、三利、平岗、定兴、大同五郡军事，督军府辖兵4万，负责抵挡南面梓、僰、淅三州可能面临的南夷人威胁。
如此一来，算上中央军、水师南北营、五大督军，整个华国的正规军已达到了65万人的规模。
而司马宇所统治的整个华国治下，四州七十八郡的郡兵加起来也有近2o万之众，再加上分布在各地的锦衣卫衙门，整个华国的兵役人口也过了9o万人。
这个比例对于人口基数过千万的华国而言，尚在正常水平之下。
不过，以华国各军军悲哀之优良，司马宇倒也足以应对随时可能生的大战。
开皇元年，这一年在后世的史书上留下了极其浓墨重彩的一笔，正是在这一年华朝这一庞大的帝国第一次以崛起之姿向世人宣告了他的到来。
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